Baruj Benacerraf, (lahir 29 Oktober 1920, Caracas, Venezuela — meninggal 2 Ogos 2011, Boston, Massachusetts, AS), ahli patologi dan imunologi Amerika kelahiran Venezuela yang berkongsi (dengan George Snell dan Jean Dausset) Hadiah Nobel Fisiologi 1980 atau Perubatan untuk penemuannya mengenai gen yang mengatur tindak balas imun dan peranan yang dimainkan oleh beberapa gen ini dalam penyakit autoimun.
Dari usia lima tahun hingga pecahnya Perang Dunia II, Benacerraf tinggal di Paris. Pada tahun 1940 dia memasuki Columbia University di New York City, dari mana dia lulus pada tahun 1942. Dia menjadi warganegara AS yang semula jadi pada tahun 1943, sementara seorang pelajar di Medical College of Virginia di Richmond. Setelah menerima MD pada tahun 1945 dan menjalani latihan di Queens General Hospital di New York City, dia berkhidmat (1946-47) di US Army Medical Corps. Benacerraf kemudian menghabiskan satu tahun dalam penyelidikan imunologi di Columbia University College of Physicians and Surgeons. Dia pindah ke Pusat Nasional Penyelidikan Ilmiah Perancis di Hospital Broussais di Paris, di mana dia terus belajar imunologi. Pada tahun 1956 dia bergabung dengan fakulti Sekolah Perubatan Universiti New York (NYU). Dia maju ke profesor patologi pada tahun 1960, jawatan yang dipegangnya hingga tahun 1968.
Di NYU Benacerraf mula mengkaji genetik sistem imun. Eksperimennya membawa kepada pengembangan konsep gen tindak balas imun (Ir), yang mengawal kemampuan sistem imun untuk bertindak balas terhadap antigen (agen berjangkit atau bahan asing yang memasuki badan). Lebih daripada 30 gen Ir kemudiannya dijumpai, dan bahan genetik tersebut ditentukan untuk menjadi sebahagian daripada kompleks histokompatibilitas utama, wilayah DNA yang rumit yang terlibat dalam tindak balas imun. Penemuan Benacerraf juga membantu menjelaskan mekanisme yang mendasari penyakit autoimun, seperti multiple sclerosis dan rheumatoid arthritis, di mana sistem kekebalan tubuh secara salah menyerang serangan pada tisu sendiri.
Pada tahun 1968 Benacerraf menjadi ketua makmal imunologi di Institut Alergi dan Penyakit Berjangkit Nasional di Bethesda, Maryland. Dari tahun 1970 hingga 1991, beliau berkhidmat sebagai profesor patologi perbandingan dan ketua jabatan patologi di Harvard University Medical School. Dia juga adalah presiden (1980–91) Institut Kanser Sidney Farber (sekarang Institut Kanser Dana-Farber) di Boston. Benacerraf terpilih ke Akademi Sains Nasional (1973) dan dianugerahkan Pingat Sains Nasional (1990). Dia menerbitkan sejumlah buku, termasuk Buku Teks Imunologi (1984) dan otobiografinya, Dari Caracas hingga Stockholm (1998).
