Gereja Bebas Filipina, Iglesia Sepanyol Filipina Independiente, juga disebut Gereja Aglipayan, gereja bebas yang diatur pada tahun 1902 setelah revolusi Filipina tahun 1896–98 sebagai protes terhadap penguasaan pendeta Sepanyol terhadap Gereja Katolik Rom. Pendiri gereja itu ialah Isabelo de los Reyes y Florentino, pengarang, pemimpin buruh, dan senator, yang dipenjarakan selama revolusi kerana mengkritik paderi dan pegawai pemerintah Sepanyol di Filipina, dan Gregorio Aglipay y Labayán, seorang paderi Katolik Rom Filipina yang dikucilkan pada tahun 1899 kerana kegiatannya atas nama revolusi. Aglipay menerima permintaan de los Reyes agar dia melayani sebagai uskup tertinggi gereja baru pada tahun 1903, suatu jawatan yang dipegangnya hingga kematiannya pada tahun 1940.
Gereja terus mengikuti bentuk pemujaan Katolik Roma, tetapi selama bertahun-tahun doktrin sangat dipengaruhi oleh Unitarianisme. Perpecahan berkembang pada tahun 1946, dan puak unitarian meninggalkan gereja. Di bawah Isabelo de los Reyes, Jr., terpilih sebagai uskup pada tahun 1946, gereja mengadopsi pada tahun 1947 deklarasi baru iman dan artikel agama yang Trinitarian. Gereja Episcopal Protestan di Amerika Syarikat menahbiskan tiga uskup Gereja Bebas Filipina pada tahun 1948, dan kedua gereja tersebut bergabung dengan sebuah persatuan erat. Pada tahun 1961 gereja ini diterima menjadi persekutuan penuh dengan Gereja England dan gereja-gereja Katolik Lama.
Pada akhir abad ke-20 keahlian adalah 1,400,000.
