Terdapat dua sumber untuk warna putih-biru-merah bendera kebangsaan Slovenia. Kerana panji etnik kebangsaannya, Slovenia telah mengadopsi salinan bendera Rusia, untuk menunjukkan solidariti dengan sesama bangsa Slavia, pada masa Perang Napoleon. Namun, sebelumnya, kaisar Rom Suci telah memberikan lambang kepada "Tanah Mahkota Carniola," yang kemudian menjadi bagian dari kerajaan. Lambang ini menampilkan perisai putih yang mengandungi helang biru dengan sabit kotak merah dan putih di payudaranya. Satu lagi lambang penting dalam sejarah Slovenia adalah yang digunakan oleh daerah Celje - perisai biru dengan tiga bintang kuning. Akhirnya, di bawah rejim komunis abad ke-20, lambang Slovenia mempunyai garis mendatar bergelombang biru dan putih untuk menunjukkan pantai Adriatik negara itu, serta gunung tiga puncak bergaya - Triglav tertinggi, Slovenia.
Slovenia mengisytiharkan kemerdekaannya pada 25 Jun 1991, tetapi harus melawan tentera Yugoslavia untuk menegakkan kedaulatannya. Bendera yang dinaikkan pada Hari Kemerdekaan adalah tricolor putih-biru-merah pan-Slavia tradisional. Untuk membezakannya dengan bendera Rusia dan Slovakia yang serupa, lambang baru Slovenia ditambahkan di sudut angkat atas yang bertindih dengan garis putih dan biru. Perisai itu menampilkan gabungan Triglav dan garis-garis bergelombang lengan komunis dengan bintang-bintang kuning pada latar belakang biru dari perisai Celje.
