Sebagai sebahagian daripada Wilayah Kepercayaan Kepulauan Pasifik (TTPI) yang ditadbir Amerika Syarikat, Palau berada di bawah bendera Pertubuhan Bangsa-Bangsa Bersatu, Amerika Syarikat, dan Wilayah Amanah. Keinginan tempatan untuk negeri dan pemerintahan yang terpisah direalisasikan pada 1 Januari 1981, dan bendera Palauan dikibarkan pada kesempatan itu. Pertandingan telah diadakan pada tahun 1979 yang menghasilkan lebih dari seribu cadangan; yang dipilih telah dibuat oleh Blau Skebong dan telah diluluskan oleh kerajaan baru pada 22 Oktober 1980. Bendera ini masih digunakan hingga kini.
Cakera emas melambangkan bulan, yang mempunyai arti khusus untuk budaya Palauan. Bulan purnama secara tradisional dianggap sebagai waktu terbaik untuk memancing, menanam, dan aktiviti lain. Dikatakan untuk memberi orang-orang lokal "perasaan hangat, ketenangan, kedamaian, cinta dan perpaduan dalam negeri." Latar belakang bendera bukan, seperti yang diharapkan, simbol Lautan Pasifik; sebaliknya, ini merujuk kepada "jalan terakhir pihak berkuasa asing dari negeri kita." Kemerdekaan penuh tidak dicapai oleh Palau hingga Oktober 1994, tetapi tidak ada perubahan pada bendera pada waktu itu. Bendera asal tahun 1981 dikekalkan di Muzium Palau di ibu kota, Koror. Bendera Palauan serupa dalam desain dengan bendera Bangladesh, tetapi keduanya memiliki warna dan simbolisme yang berbeda.
