Pada abad ke-16 William I, putera Orange, menjadi pemimpin gerakan kemerdekaan Belanda menentang Sepanyol. Berdasarkan lengan wilayah leluhurnya Orange, William menggunakan warna warna oren, putih, dan biru. Pada pengepungan Leiden pada tahun 1574, askar mengenakan warna-warna itu pada pakaian seragam mereka, dan popularitas warna di kalangan nasionalis Belanda kemudiannya tersebar. Provinsi Zealand mempunyai warna yang serupa: benderanya menunjukkan singa merah yang timbul dari jalur biru dan putih yang mewakili laut. Bendera Belanda di laut setelah tahun 1577 adalah warna tiga warna oren-putih-biru mendatar, walaupun tidak pernah diadopsi secara rasmi. Begitu juga, tidak pernah ada pengakuan rasmi yang diberikan kepada penggantian oren dengan warna merah, transformasi yang diselesaikan pada tahun 1660. Ini adalah masa yang tepat untuk menghilangkan oren dari bendera, kerana pada tahun 1654 perjanjian pertahanan antara Belanda dan Inggeris dikecualikan secara kekal anggota rumah Orange daripada menjadi ketua negara di Belanda. (Pada abad ke-20 banyak Belanda sayap kanan menyokong oren-putih-biru sebagai "bendera asli" Belanda, tetapi bendera kebangsaan tidak diubah.)
Setelah revolusi mereka pada tahun 1789, Perancis mengiktiraf merah, putih, dan biru sebagai "warna kebebasan" dan menghormati Belanda kerana pertama kali menggunakannya dalam bendera (lihat Perancis, bendera). "Patriot" Pro-Perancis di Belanda mengambil langkah pertama mengenai bendera rasmi Belanda ketika Republik Batavia mereka mengesahkan warna tiga warna merah-putih-biru pada 14 Februari 1796. Ketika saudara Napoleon, Louis, menjadi pemerintah Kerajaan Belanda pada tahun 1806, tidak ada perubahan yang dibuat dalam bendera kebangsaan. Belanda dianeksasi oleh Perancis dari tahun 1810 hingga 1813, tetapi, setelah kemerdekaan kembali, Kerajaan Belanda yang baru kembali mengiktiraf bendera merah-putih-biru. Bendera tersebut, yang baru-baru ini ditegaskan kembali oleh keputusan kerajaan pada 19 Februari 1937, telah mengilhami penggunaan warna yang sama pada bendera kebangsaan negara-negara lain. Walaupun terdapat persamaan visual antara bendera Belanda dan bendera Luxembourg, tidak ada hubungan yang didokumentasikan antara kedua-dua reka bentuk tersebut.
