Lapisan kapsul dan lendir
Banyak sel bakteria mengeluarkan beberapa bahan ekstraselular dalam bentuk kapsul atau lapisan lendir. Lapisan lendir secara longgar dikaitkan dengan bakteria dan mudah dicuci, sedangkan kapsul melekat erat pada bakteria dan mempunyai batas yang pasti. Kapsul dapat dilihat di bawah mikroskop cahaya dengan meletakkan sel-sel ke dalam suspensi dakwat India. Kapsul tidak termasuk dakwat dan muncul sebagai lingkaran cahaya yang mengelilingi sel bakteria. Kapsul biasanya merupakan polimer gula sederhana (polisakarida), walaupun kapsul Bacillus anthracis terbuat dari asid poliglutamat. Sebilangan besar kapsul bersifat hidrofilik ("mencintai air") dan dapat membantu bakteria mengelakkan pengeringan (dehidrasi) dengan mencegah kehilangan air. Kapsul dapat melindungi sel bakteria dari pengambilan dan pemusnahan oleh sel darah putih (fagositosis). Walaupun mekanisme yang tepat untuk melarikan diri dari fagositosis tidak jelas, ia mungkin berlaku kerana kapsul membuat komponen permukaan bakteria menjadi lebih licin, membantu bakteria untuk melepaskan diri dari selaput sel fagosit. Kehadiran kapsul dalam Streptococcus pneumoniae adalah faktor yang paling penting dalam keupayaannya untuk menyebabkan radang paru-paru. Strain mutan S. pneumoniae yang telah kehilangan kemampuan untuk membentuk kapsul mudah diserap oleh sel darah putih dan tidak menyebabkan penyakit. Hubungan virulensi dan pembentukan kapsul juga terdapat di banyak spesies bakteria lain.
Lapisan kapsul dari bahan polisakarida ekstraselular dapat merangkumi banyak bakteria ke dalam biofilm dan melayani banyak fungsi. Streptococcus mutans, yang menyebabkan karies gigi, membelah sukrosa dalam makanan dan menggunakan salah satu gula untuk membina kapsulnya, yang menempel pada gigi. Bakteria yang terperangkap dalam kapsul menggunakan gula lain untuk meningkatkan metabolisme mereka dan menghasilkan asid kuat (asid laktik) yang menyerang enamel gigi. Apabila Pseudomonas aeruginosa menjajah paru-paru orang dengan fibrosis kistik, ia menghasilkan polimer kapsul asid alginik tebal yang menyumbang kepada kesukaran membasmi bakteria. Bakteria genus Zoogloea mengeluarkan serat selulosa yang menjadikan bakteria menjadi flok yang terapung di permukaan cairan dan membuat bakteria terkena udara, suatu syarat untuk metabolisme gen ini. Beberapa bakteria berbentuk batang, seperti Sphaerotilus, mengeluarkan selubung tubular kompleks kimia panjang yang merangkumi sejumlah besar bakteria. Selubung ini dan banyak bakteria persekitaran lain dapat bertabur dengan besi atau oksida mangan.
Flagella, fimbriae, dan pili
Banyak bakteria bergerak, dapat berenang melalui medium cair atau meluncur atau mengerumuni permukaan yang padat. Bakteria berenang dan berkumpul memiliki flagela, yang merupakan pelengkap ekstraselular yang diperlukan untuk pergerakan. Flagella adalah filamen heliks panjang yang terbuat dari satu jenis protein dan terletak di hujung sel berbentuk batang, seperti di Vibrio cholerae atau Pseudomonas aeruginosa, atau di seluruh permukaan sel, seperti di Escherichia coli. Flagella dapat dijumpai pada batang gram positif dan gram negatif tetapi jarang terdapat pada cocci dan terperangkap dalam filamen paksi di spirochetes. Flagellum dilekatkan di pangkalnya ke badan basal dalam membran sel. Daya protomotif yang dihasilkan pada membran digunakan untuk memutar filamen flagellar, dengan cara turbin yang digerakkan oleh aliran ion hidrogen melalui badan basal ke dalam sel. Apabila flagella berputar ke arah lawan jam, sel bakteria berenang dalam garis lurus; putaran mengikut arah jam menghasilkan berenang ke arah yang berlawanan atau, jika terdapat lebih dari satu flagellum per sel, secara bergantian jatuh. Chemotaxis membolehkan bakteria menyesuaikan tingkah laku berenangnya sehingga dapat merasakan dan berpindah ke arah peningkatan kadar bahan kimia penarik atau jauh dari bahan penghalau.
Bakteria tidak hanya dapat berenang atau meluncur ke lingkungan yang lebih baik, tetapi mereka juga memiliki pelengkap yang memungkinkan mereka melekat pada permukaan dan terhindar dari hanyut oleh cairan yang mengalir. Beberapa bakteria, seperti E. coli dan Neisseria gonorrhoeae, menghasilkan unjuran lurus, kaku, spikelike yang disebut fimbriae (bahasa Latin untuk "benang" atau "serat") atau pili (bahasa Latin untuk "rambut"), yang memanjang dari permukaan bakteria dan melekat pada gula khusus pada sel lain - untuk sel-sel epitelium strain, usus atau saluran kencing ini. Fimbriae hanya terdapat pada bakteria gram negatif. Pili tertentu (disebut sex pili) digunakan untuk membolehkan satu bakteria mengenali dan mematuhi yang lain dalam proses perkawinan seksual yang disebut konjugasi (lihat di bawah Pembiakan bakteria). Banyak bakteria akuatik menghasilkan lendir mukopolisakarida yang berasid, yang membolehkannya melekat erat pada batu atau permukaan lain.
