Perjuangan pembebasan di Tanganyika dipimpin oleh Tanganyika African National Union, yang benderanya berwarna tiga melintang hijau-hitam-hijau. Pilihan raya mengesahkan sokongan popular yang sangat besar untuk organisasi itu, dan pihak berkuasa Britain mencadangkan untuk mengubah bendera parti untuk digunakan sebagai bendera kebangsaan selepas kemerdekaan pada 9 Disember 1961. Fimbriasi kuning ditambahkan pada masa itu.
Di bawah pemerintahan Arab, Zanzibar telah lama mengibarkan bendera merah, tetapi rejim Afrika hitam berkuasa pada 12 Januari 1964, di bawah bendera hitam, kuning, dan biru. Pada bulan berikutnya, Parti Afro-Shirazi yang berkuasa memperkenalkan bendera kebangsaan baru yang serupa dengan bendera mereka. Jalur biru-hitam-hijau mendatar berdiri untuk laut, orang-orang, dan daratan, masing-masing, sementara jalur menegak putih sempit di kerekan adalah untuk kedamaian.
Pada bulan April 1964, negara-negara Tanganyika dan Zanzibar bersatu, dan pada awal Juli tradisi bendera mereka disatukan untuk membuat bendera kebangsaan baru Tanzania. Warna bendera digabungkan secara menyerong untuk keunikan. Majoriti penduduk negara ini dilambangkan dengan jalur hitam, sementara hijau menunjukkan sumber pertanian yang kaya dengan tanah. Kekayaan mineral ditunjukkan dalam sempadan kuning yang sempit, sementara Lautan Hindi dilambangkan dengan warna biru. Setelah Zanzibar bersatu dengan Tanganyika, bendera Zanzibar tetap digunakan secara lokal di pulau-pulau tersebut.
